清华大年夜学智能家当研究院(AIR)兰艳艳传授结合生命学院和化学系的团队,成功研发出了 AI 驱动的超高通量药物虚拟筛选平台 DrugCLIP。研究成果以《深度比较进修实现基因组级别药物虚拟筛选》(Deep contrastive learning enables genome-wide virtual screening)为题在线揭橥于《科学》(Science)。
在当前的药物研发范畴,针对靶向药物的摸索仅覆盖了人类可成药靶点的约10%。面对成千上万的潜在靶点,如安在广阔的化学空间中快速筛选苗头化合物已成为该范畴里的瓶颈。
DrugCLIP 初次打通了从蛋白构造猜测到药物发明的关键通道,实现覆盖人类基因组范围的虚拟筛选。
硬件方面,基于128核中心处理器(CPU)和8张图形处理器(GPU)的计算节点,DrugCLIP即可实现万亿级蛋白口袋小分子对打分日吞吐才能,其核心冲破在于将传统的分子对接转化为蛋白口袋与小分子。在向量空间中的高效语义检索,较分子对接等传统办法的速度晋升百万倍。
根据介绍,DrugCLIP筛选速度比较传统办法实现了百万倍晋升,同时在猜测精确率上也取得明显冲破。依托该平台,团队初次完成了覆盖人类基因组范围的药物虚拟筛选,为立异药物发明带来了新的可能性。

依托 DrugCLIP 平台,研究团队初次完成了覆盖人类基因组范围的药物虚拟筛选。这一过程不仅涉及到约1万个蛋白靶点和2万个蛋白口袋,还分析筛选了跨越5亿个类药小分子,最终富集出跨越200万个潜在活性分子。构建了今朝已知最大年夜范围的蛋白-配体筛选数据库,该数据库已免费面向全球科研社区开放。

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