单细胞状态转变的可解释球面几何：主导主成分投影
研究提出SPHERE-PCA方法，将单细胞基因表达的主导主成分投影到单位球面，以获得可解释的坐标系统。 方法对前三个主成分坐标做L2归一化，将生物学定义的根节点对齐北极，用测地距离θ、角位置φ与投影前径向幅度r表示每个细胞。
重析应激颗粒转录组提示线粒体RNA富集
重新分析公开人类应激颗粒转录组后，提示其中可能存在线粒体RNA富集。 研究整合多种应激条件、细胞类型与分离策略的公开数据，比较差速离心与邻近标记结果。
星形胶质细胞sEH-EET信号调控小胶质细胞溶酶体与STING通路（小鼠与iPSC研究）
在5xFAD小鼠中遗传性敲除sEH可减少I型干扰素应答的小胶质细胞亚群并降低pSTING水平，星形胶质细胞特异性而非内皮特异性sEH敲除可重现该表型；结果提示星形胶质细胞sEH-EET轴调控小胶质细胞STING信号，但证据来自预印本动物与细胞模型。 设计为多组学与遗传学干预研究：
利用大片段插入的基因编辑
该文探讨以大规模插入片段实现基因编辑的策略，具体结论受限于仅有标题的信息。 因摘要缺失，无法确认研究设计、样本量或实验体系，仅知属基因编辑方法类工作。
单细胞可视化蛋白质组学揭示最小细菌基因表达机器结构协调
证据支持：该研究以单细胞可视化蛋白质组学手段，在最小细菌中观察到基因表达机器之间存在结构层面的协调关系，方向为正向关联，但材料仅给出标题与出处，强度无法量化。 研究设计与做法：材料未报告。仅知为发表于 Cell 的资讯条目，在线日期为 2026 年 9 月 25 日，作者包括 J
minimap2：面向长读长与剪接序列的通用比对工具
minimap2 是一个将 DNA 或 mRNA 序列比对到大型参考数据库的通用序列比对程序，支持长读长、剪接感知比对、重叠检测与组装比对等多种场景。
COSMIC双向生成模型连接核形态与基因表达
预印本提出COSMIC双向生成框架，提示核形态与基因表达之间存在可量化的双向关联，但该结论基于模型推断，尚属证据支持有限的探索性发现，不足以确立因果关系。 研究为计算方法学开发，预训练使用超过2100万个分割细胞核，并在IRIS技术获取的同细胞高分辨图像与转录组多模态数据上建模；
人工栽培虫草"子座败育"：青霉富集 + 微生物组网络失稳（多组学）
背景：冬虫夏草由真菌 Ophiocordyceps sinensis 寄生蝙蝠蛾科幼虫形成（子座 + 菌核），但人工栽培受"子座败育"制约，严重影响产量与品质；真菌—宿主昆虫—土壤三者互作至关重要。 多组学比较正常与异常发育样本，分析被真菌定殖的宿主幼虫与菌际土壤中的微生物群落与
BWA：短读长序列比对工具
BWA 是基于 Burrows-Wheeler 变换的 DNA 序列比对软件，用于将短读长序列比对到大型参考基因组，如人类基因组。
利什曼原虫起始密码子序列调控翻译偶联mRNA降解
在利什曼原虫中，起始密码子周边序列（Kozak序列）被提示参与翻译起始偶联的mRNA降解，进而影响蛋白表达与转录本丰度；该结论基于预印本，证据档位为C，尚不足以下结论。 研究采用生物信息学比较与转基因L. donovani株系实验：在锥虫基因组中比对Kozak序列偏好，并构建由不
