COSMIC双向生成模型连接核形态与基因表达

bioRxiv 预印本 · 2026-09-30 · 预印本

• 一句话结论：预印本提出COSMIC双向生成框架，提示核形态与基因表达之间存在可量化的双向关联，但该结论基于模型推断，尚属证据支持有限的探索性发现，不足以确立因果关系。
• 研究设计与做法：研究为计算方法学开发，预训练使用超过2100万个分割细胞核，并在IRIS技术获取的同细胞高分辨图像与转录组多模态数据上建模；材料未报告具体样本量、干预对照与随访时长。
• 主要结果：模型可分解反映于核形态的转录方差及由基因表达解释的形态方差，并识别表达与核形态共变的基因；在前列腺癌细胞中区分化疗应答与耐药状态，在斑马鱼胚胎空间转录组中揭示局部细胞邻域对形态-表达关系的影响；具体效应量与p值材料未报告。
• 机制或解释：作者解释为：基于配对单细胞测量的生成建模可量化核形态与基因表达共享的信息，从而为机制发现提供新途径；该解释属框架性论述，未提供分子机制的直接验证。
• 局限与边界：局限包括：属预印本未经同行评审；证据档位为C；材料未报告人群代表性、中心数量、随访时长与利益冲突；跨物种、跨细胞类型的泛化能力尚不明确。
• 可否落地：对科研的实际含义是提示可将核形态作为转录状态的补充读出用于假设生成；对临床尚无直接应用证据。整体证据档位为「提示」，不足以支持诊断或治疗决策。

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Wen, S., Vinas, R., Bues, J. 等

本文摘自《每日前沿研究简报 · 2026-10-02》「生物信息 / 组学（单细胞·差异表达）」。本内容仅用于研究信息整理与科普交流，不构成医疗建议。