肝内胆管癌：三级淋巴结构异质性的时空图谱（214 + 155 例 + 空间多组学）
Science Advances · 2026-09-09 · 期刊论文 肝内胆管癌（iCCA）预后极差、治疗选择有限。本研究构建了三级淋巴结构（TLS）的 多模态空间图谱 ，确认 肿瘤内 TLS（iTLS）为独立预后标志物 。 蛋白组学：
OSA缺氧与代谢重编程及动脉粥样硬化致病网络与候选生物标志物分析
基于转录组与单细胞数据的探索性分析提示，阻塞性睡眠呼吸暂停（OSA）中C17ORF91、HBEGF、PGBD2、ZNF616四个枢纽基因与缺氧反应、动脉粥样硬化及代谢重编程通路相关，但证据尚不足以确立其生物标志物地位。 研究为公共数据集二次分析：RNA-seq数据集GSE7509
144例肝内胆管癌基因组与空间免疫图谱揭示TIGIT相关免疫活化亚型
在144例肝内胆管癌（iCCA）队列中，整合转录组、DNA panel测序与多重免疫组化分析显示，免疫检查点调控呈明显的情境依赖性异质性；TIGIT可界定一个免疫活化亚型，提示其作为分层生物标志物的可能，但证据档位为C，尚不足以下临床结论。 研究为单队列观察性分子与空间免疫图谱分
GWAS与基因编辑解析紫花苜蓿MsCBF8-MsGolS2耐旱调控模块
该研究提示，MsCBF8作为耐旱正调控因子，通过直接结合MsGolS2启动子GCCGAC顺式元件激活其表达，过表达可增强苜蓿耐旱性且不损害生长，但结论主要来自同源四倍体背景下的遗传与生理实验。 设计为遗传学功能研究：在苜蓿中开展全基因组关联分析（GWAS）鉴定出CBF/DREB1
GCB-DLBCL高CNV暗区恶性细胞状态与不良预后
在GCB-DLBCL中，单细胞与批量转录组整合分析识别出一个高拷贝数变异（CNV）、富集暗区样程序的恶性细胞状态M-C2，其丰度升高与总生存期较差相关，并伴抗原呈递能力下降。 研究整合单细胞转录组与推断CNV分析刻画恶性B细胞状态，采用调控子分析、功能注释与scPAGWAS探讨调
血浆蛋白组学对新诊断原发中枢神经系统淋巴瘤的预后分层
在新诊断原发中枢神经系统淋巴瘤（PCNSL）患者中，基于基线血浆蛋白组学可划分出两种蛋白组状态，其中炎症型状态与更短的总生存和无进展生存相关，提示其可能具有预后分层价值。 研究为预后标志物开发与验证设计，纳入法国LOC网络162例新诊断PCNSL患者基线血浆，训练集84例、测试集
稻瘟病菌种复合体：宿主专一化的"受限可塑性"框架
背景：稻瘟病威胁全球水稻生产，小麦瘟的出现说明该病原具备宿主跳跃能力；Magnaporthe oryzae 并非均一种，而是遗传分化、宿主适应的谱系复合体。 框架：整合演化基因组学、转录组学与代谢组学，提出"受限可塑性（Constrained Plasticity）"，认为宿主适
绿色合成辣椒源MgO纳米颗粒对耐多药溶血葡萄球菌生物膜及MCF-7细胞的影响
结论：辣椒提取物介导合成的MgO纳米颗粒（CAE/MgONPs）在体外可降低部分耐多药溶血葡萄球菌分离株的生物膜生物量，并浓度依赖地降低MCF-7细胞活力；但抗生物膜与转录调控效应呈菌株依赖性，方向不一致，证据档位为C，尚不足以下结论。 设计：体外实验研究。自20份血液标本分离出
非小细胞肺癌：TXNRD1 经 TGF-β1 自分泌环驱动细胞可塑性与干性
数据挖掘：在 TCGA 与 GEO 中分析分期进展相关基因谱（侧重氧化还原基因家族）；TCGA 显示 TXNRD1 在晚期 NSCLC 中表达约为 2 倍，并在肿瘤组织中验证。 细胞实验：在 A549、H226、H1299 中过表达或敲低 TXNRD1（CRISPR/Cas9 或
整合转录组与单细胞分析提示CD74为肾结石肾小管细胞铁死亡候选调控因子
研究提示CD74可能与肾结石中肾小管上皮细胞的铁死亡相关损伤有关，并可能涉及NF-κB信号通路。 采用乙醛酸诱导小鼠模型，结合批量转录组、蛋白互作与单细胞分析，观察草酸钙沉积、肾功能及铁死亡相关指标变化。
