肝内胆管癌：三级淋巴结构异质性的时空图谱（214 + 155 例 + 空间多组学）

Science Advances · 2026-09-09 · 期刊论文

• 肝内胆管癌（iCCA）预后极差、治疗选择有限。本研究构建了三级淋巴结构（TLS）的多模态空间图谱，确认肿瘤内 TLS（iTLS）为独立预后标志物。
• 蛋白组学：214 例发现队列 + 155 例验证队列，建立四级 TLS 分型的肿瘤微环境分类系统，并训练出 TLS 预测随机森林分类器。成像质谱流式（IMC）显示 iTLS+ 肿瘤具有结构化免疫架构——M1 样组织驻留巨噬细胞、树突状细胞与 CXCL13+ CD4+ T 细胞共定位，形成"抗原呈递邻域"（apc-CNs）并与 TLS 核心区（TLScore-CNs）空间耦合。
• 单细胞空间转录组学把 61 个 TLS 解析为 14 个空间微环境，并定义出"聚集 → 激活 → 后激活"的拟时序成熟连续谱；邻域内通讯主要由 ifnCAFs、iCAFs 与 CXCL12+ 巨噬细胞介导并随成熟动态演化（聚集态中外周环带 vs 激活态中浸润内部）。单核 RNA 测序 + Tangram 空间映射进一步交叉验证。
• 看点：这是"多模态空间组学讲完整故事"的标杆案例：bulk 蛋白组定分型 → IMC 看架构 → 空间转录组定微环境 → snRNA-seq 定细胞来源。对做生信的内容与服务而言，"分型 + 空间 + 拟时序"是目前最能出成果的三件套。
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本文摘自《每日前沿研究简报 · 2026-09-10》「六、生物信息 / 组学：空间图谱与时序节律」。本内容仅用于研究信息整理与科普交流，不构成医疗建议。