桔梗皂苷D的血管效应依情境而异：抑制新生内膜却加重动脉粥样硬化并涉及mTORC1信号
结论：桔梗皂苷D（PD）在无脂质负荷的血管损伤模型中可抑制新生内膜形成，但在高脂血症背景下加重早期动脉粥样硬化，其血管结局依脂质与血流情境而定，属证据支持的方向性结论，但强度受模型与样本量限制。 设计：整合网络药理学、分子对接、100 ns分子动力学模拟、血管平滑肌细胞（VSMC
TorchDrug：基于PyTorch的图结构药物发现机器学习工具箱
TorchDrug 是一个基于 PyTorch 的机器学习工具箱，专注于图结构数据，为药物发现提供图操作、分子表示和快速原型开发能力。
通路驱动的机器学习与虚拟筛选框架识别抗类风湿关节炎天然小分子
结论：研究构建了整合机器学习、靶点优选与虚拟筛选的通路驱动框架，将补体与凝血级联及C3AR1列为候选，并优先推荐天然化合物SM1；但外部验证判别力有限，整体属「提示」层面，证据档位为C。 设计与做法：纳入16个RA相关GEO数据集，15个队列用于建模、1个留作独立外部验证；以GS
网络药理学与计算模拟设计靶向PTP1B变构位点的simufilam类衍生物用于阿尔茨海默病神经保护
结论（计算预测层面）：基于网络药理学与分子模拟，衍生物A20被预测可结合PTP1B非竞争性变构位点，并显示较优的结合能、轨迹稳定性与类药性，作者据此将其定位为待实验验证的先导候选；该结论属计算预测，尚不足以作为疗效结论。 设计与做法：研究为纯计算机模拟研究，未涉及人体或动物实验。
Gomisin A多靶点药理机制、药代动力学与网络药理学综述
结论：综述认为Gomisin A具有多靶点药理潜力，其中保肝为临床前证据支持最充分的适应证，但整体仍属临床前层面，尚不足以下临床结论。 设计与做法：为叙述性综述，检索PubMed与中国知网数据库，对机制证据按支持强度分层，并辅以网络药理学筛选、分子对接与分子动力学模拟；样本量与随
qcGEM：融合量子化学信息的图分子表征及83项任务评估
结论：作者提出一种融合量子化学先验的图分子表征qcGEM，并在83项分子相关任务上报告了优于现有方法的性能；该结论来自作者自评的基准比较，属计算研究层面的证据支持，尚不涉及湿实验或临床验证。 设计与做法：研究为方法学开发与基准评测，非人体或动物实验。作者设计专门模型架构处理量子化
新型取代噻唑衍生物的设计合成与DHFR抑制的计算机模拟分析
作者提示TB10、TB22、TB4与TB24对金黄色葡萄球菌DHFR的预测结合亲和力最高，并具可接受的口服类药性与较低预测毒性；该结论来自分子对接与ADME预测，属计算层面提示。 设计合成25个噻唑衍生物（TB1–TB25），经Hantzsch环化、酰氯活化与取代苯胺偶联制备，结
基于网络药理学与转录组学筛选药食同源植物中AML预后基因及候选治疗靶点
结论（方向与强度）：通过网络药理学与转录组学整合分析，从106种药食同源植物中筛出候选基因与核心活性成分，并识别出6个AML潜在预后基因；证据属生物信息学预测与体外表达验证层面，尚不足以支持临床疗效结论。 研究设计与做法：材料未报告研究类型的具体界定；做法为系统分析AML公共组学
CapV荧光探针优化及环二核苷酸结构对CapV激活的影响
结论：通过延长resorufin酯探针的酰基链，可获得对cGAMP激活依赖性更高的CapV荧光报告体系；据此提示环二核苷酸的磷酸二酯骨架与2'-羟基是维持CapV激活的关键结构要素（证据支持，基于体外酶学与计算模拟）。 设计：体外基础研究，非人体或动物样本；以来自Acinetob
整合虚拟筛选、DFT与分子动力学鉴定SARS-CoV-2 Mpro天然产物抑制剂
结论：通过整合虚拟筛选、DFT与分子动力学模拟，从天然产物库中识别出Lig14为SARS-CoV-2 Mpro的候选抑制剂；该结论完全基于计算预测，属提示性证据，尚不足以下实验结论。 设计：纯计算机辅助药物设计研究，无实验与人群；从ZINC15天然产物库224,205个分子出发，
