qcGEM：融合量子化学信息的图分子表征及83项任务评估
结论：作者提出一种融合量子化学先验的图分子表征qcGEM，并在83项分子相关任务上报告了优于现有方法的性能；该结论来自作者自评的基准比较，属计算研究层面的证据支持，尚不涉及湿实验或临床验证。 设计与做法：研究为方法学开发与基准评测，非人体或动物实验。作者设计专门模型架构处理量子化
网络药理学与计算模拟设计靶向PTP1B变构位点的simufilam类衍生物用于阿尔茨海默病神经保护
结论（计算预测层面）：基于网络药理学与分子模拟，衍生物A20被预测可结合PTP1B非竞争性变构位点，并显示较优的结合能、轨迹稳定性与类药性，作者据此将其定位为待实验验证的先导候选；该结论属计算预测，尚不足以作为疗效结论。 设计与做法：研究为纯计算机模拟研究，未涉及人体或动物实验。
新型取代噻唑衍生物的设计合成与DHFR抑制的计算机模拟分析
作者提示TB10、TB22、TB4与TB24对金黄色葡萄球菌DHFR的预测结合亲和力最高，并具可接受的口服类药性与较低预测毒性；该结论来自分子对接与ADME预测，属计算层面提示。 设计合成25个噻唑衍生物（TB1–TB25），经Hantzsch环化、酰氯活化与取代苯胺偶联制备，结
湖贝碱在糖尿病模拟结直肠癌模型中抑制肿瘤细胞表型并调节巨噬细胞标志物
结论：体外与生物信息学结果提示IL1β-CXCL8-CXCR2轴可能是糖尿病与结直肠癌界面的候选炎症模块，湖贝碱为其多靶点配体，可降低HCT116细胞活力、迁移与侵袭并改变巨噬细胞标志物谱；证据档位C。 设计与做法：整合生物信息学与蛋白互作网络分析筛选共享基因，结合TCGA与单细
基于网络药理学与转录组学筛选药食同源植物中AML预后基因及候选治疗靶点
结论（方向与强度）：通过网络药理学与转录组学整合分析，从106种药食同源植物中筛出候选基因与核心活性成分，并识别出6个AML潜在预后基因；证据属生物信息学预测与体外表达验证层面，尚不足以支持临床疗效结论。 研究设计与做法：材料未报告研究类型的具体界定；做法为系统分析AML公共组学
含杂环药效团的8-羟基喹啉席夫碱杂合物体外抗菌评价
结论：新合成的8-羟基喹啉席夫碱杂合物在体外对受试菌株显示抑菌活性，其中SSAJ-06活性最高；属体外筛选，证据档位为C。 设计：化学合成与体外药敏研究；设计合成SSAJ-01至SSAJ-06共6个化合物，经FT-IR、核磁与质谱表征，用纸片扩散法和肉汤微量稀释法测试2株革兰阳性
嘧啶并噻唑-异噁唑偶联物作为双胆碱酯酶抑制剂的合成与体外评价
结论：新合成的嘧啶并噻唑并异噁唑类化合物在体外对乙酰胆碱酯酶（AChE）和丁酰胆碱酯酶（BuChE）均显示低微摩尔级抑制活性，先导化合物-1的IC50低于对照药多奈哌齐；证据支持其作为双靶点先导骨架，尚不足以支持临床有效性。 设计：属化学合成与体外生物学评价的临床前研究，样本量为
从粗粒化分子动力学到生物分子凝聚体连续模型：以FUS低复杂度结构域为例
结论：Cahn-Hilliard方程可描述无序蛋白相分离的动力学过程，自由能泛函可跨阶段迁移而迁移率不可；属计算模拟层面的「证据支持」，实验外推不足以下结论。 设计：计算建模研究，以FUS低复杂度结构域为模型体系，用粗粒化分子动力学模拟推断Cahn-Hilliard方程中的自由能
肿瘤血管生成调控因子RhoJ新型药物口袋的识别与靶向：分子动力学与细胞生物传感器研究
研究通过分子动力学模拟识别出由RhoJ N端延伸形成的新的别构口袋，并发现抗真菌药特康唑可占据该口袋、剂量依赖地破坏RhoJ与PAK3的相互作用，为选择性靶向RhoJ提供概念验证；证据档位C，属临床前提示。 设计为计算与细胞实验结合：分子动力学模拟、基于结构的虚拟筛选与分子对接，
基于Metal Mer的金属酶从头设计流程及锌、铁催化变体构建
研究提出一条可直接从计算获得高效金属酶的流程，以Metal Mer结构单元高置信度构建金属结合位点，所设计锌依赖氢转移酶变体在13种底物上ee>99%且无需定向进化；铁催化烯烃双官能化变体亦具初始活性，证据提示该流程可扩展金属酶可及反应范围。 为计算设计与实验验证相结合的方法学研
