东亚人群转录组与甲基化组关联研究优先定位肺癌基因

PLOS Genetics · 2026-11-06 · 期刊论文

• 一句话结论：结论：作者构建东亚人群特异性表达与甲基化预测模型并用于肺癌GWAS，发现阶段识别25个基因与42个CpG位点与肺癌风险相关，其中7个基因与32个CpG位点重复验证；关联方向为风险相关，证据档位C，属关联性证据。
• 研究设计与做法：设计：TWAS/MWAS整合分析；表达预测模型基于800余人全血数据，甲基化预测模型基于4300余人全血数据；应用南京医科大学肺癌GWAS（13327例/13328对照）与日本生物样本库（4444例/489012对照），分发现与重复验证阶段，并辅以孟德尔随机化分析。
• 主要结果：结果：发现阶段25个基因、42个CpG位点与肺癌风险相关，重复阶段7个基因、32个CpG位点获重复；在已知GWAS位点之外识别3个新基因RP11-57K17.1（6q22.31）、RP11-313J2.1（10q11.21）、BMS1P2（10q11.22）；孟德尔随机化提示RP11-147L13.11甲基化介导的下调可能降低肺癌风险；具体效应量与p值材料未报告。
• 机制或解释：机制：作者以遗传-表观遗传调控解释，即DNA甲基化介导基因表达改变进而影响肺癌易感性；并指出主要基于欧洲参考数据的模型限制跨人群推广，故构建东亚特异性预测模型。
• 局限与边界：局限：预测模型基于全血组织，与肺组织可能存在差异；病例对照来源为单一国家医院与生物样本库，人群代表性有限；孟德尔随机化结果仅为提示性；随访时长、多重检验校正细节与利益冲突材料未报告。
• 可否落地：落地：对科研提示东亚人群特异性多组学预测模型可提升TWAS/MWAS跨人群适用性，新基因与CpG位点可作为后续功能验证候选；对临床筛查或风险预测尚不足以下结论，需独立队列与功能实验支持。

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本文摘自《每日前沿研究简报 · 2026-11-08》「PLOS Genetics」。本内容仅用于研究信息整理与科普交流，不构成医疗建议。