DSRCT 80基因候选靶点图谱：61例患者双队列RNA检测与融合抑制验证

Cancer Genomics & Proteomics · 2026-10-31 · 期刊论文

• 一句话结论：结论：研究构建了DSRCT的80基因候选靶点图谱，在61例患者中多数候选基因RNA可检出，但作者强调RNA检出本身不足以确立蛋白丰度、治疗可及性、疗效或安全性，证据档位为C。
• 研究设计与做法：设计：基于两个bulk RNA测序队列（61例患者、86份肿瘤标本），按各队列原生CPM或TPM尺度将技术文库合并至标本、标本合并至患者，并做阈值与合并规则敏感性分析；另纳入单细胞（2份标本、9520个细胞）、空间转录组（5例患者、6份标本）、3个融合抑制队列、1个细胞状态队列及HPA/GTEx正常组织参考作为探索性支持数据。
• 主要结果：结果：CD276、CD200、ERBB2、ALCAM、IGF2、TFRC及诊断标志物CACNA2D2在61/61例患者中检出；CLDN6为33/61例（54%，Wilson 95%CI 42-66%），SSTR3为59/61例（97%，95%CI 89-99%）；CACNA2D2、FGFR4、MSLN在3个融合抑制队列中EWSR1::WT1抑制后表达均下降，其他候选基因结果队列间不一致。
• 机制或解释：机制：作者以EWSR1::WT1融合驱动为背景，通过融合抑制后表达变化判断靶点是否受融合调控；单细胞与空间转录组用于评估细胞来源，正常组织参考用于评估正常组织表达，但具体机制通路未报告。
• 局限与边界：局限：两个bulk队列的合并规则与阈值需敏感性分析支持；单细胞仅2份标本且共享同一匿名患者标签；空间转录组仅5例患者；探索性数据样本量小；利益冲突材料未报告。
• 可否落地：落地：图谱为每个靶点指明下一步所需验证研究，属早期靶点筛选证据，证据档位C；RNA检出不能直接支持临床用药选择，需蛋白水平、可及性与安全性验证，尚不足以下结论。

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Corey Keith Goldman

本文摘自《每日前沿研究简报 · 2026-11-02》「生物信息 / 组学（单细胞·差异表达）」。本内容仅用于研究信息整理与科普交流，不构成医疗建议。