BioMod：以生物模块为单元的单细胞基础模型
作者提出以生物模块作为基因与细胞之间的中间表征单元，构建了约5000万参数的单细胞基础模型BioMod，并在细胞类型注释、零样本批次整合、扰动响应预测与药物响应预测等任务上报告了当前最优性能，方向为性能提升，但属预印本证据。 研究为方法学建模工作：构建了由人工整理通路与数据驱动基
MMseqs2：超快速灵敏的序列搜索与聚类套件
MMseqs2 是用于搜索和聚类大规模蛋白质与核苷酸序列集合的开源软件套件，面向海量序列数据的比对、聚类与分类需求。
伊利诺伊州三种医学重要蜱的贝叶斯空间预测
结论方向：模型提示美洲钝眼蜱在伊州南部相对丰度最高、肩突硬蜱集中于北部、变异革蜱分布广泛；属预测性建模结果，非因果或干预证据。 研究设计与做法：基于2019—2022年监测数据构建贝叶斯分层空间模型，以β-二项模型在INLA中纳入气候、土地覆盖、森林破碎化、鹿栖息地适宜性与BYM
SIV持续储存库的组织病毒微环境与应激反应激活
在SIV感染猕猴模型中，持续储存库的病毒反弹源自肠黏膜内转录活跃的离散病灶，其组织状态以应激反应、代谢、线粒体与细胞周期程序激活为特征，证据档位为预印本，提示病毒微环境可能参与储存库持久性。 研究采用免疫PET/CT引导采样结合空间转录组学，比较感染后早期启动ART（短暂储存库）
生命科学方向雷达 · 2026-W42｜状态坐标化、多组学整合、流程可审计
生命科学方向雷达：细胞状态坐标化：先定坐标再谈差异、多组学证据链：从单层关联到跨模态对齐、长读长与序列工具：把比对参数变成可审计流程。单细胞与空间组学的提问正从“有没有差异”转向“状态坐标怎么定、证据链怎么整合”，本期多条图谱与方法学工作都先做坐标化再谈差异。
CAM植物Sansevieria cylindrica叶片沿轴生理代谢对热旱的空间梯度响应
在热、热旱复合与复水三阶段中，CAM植物圆柱虎尾兰叶片的水分、光合与中心碳代谢沿叶轴呈现空间分化：基部水分下降先于顶端，顶端PSII量子产率在热旱复合期下降，提示叶内梯度可区分空间结构与动态胁迫响应，属预印本层面的提示性证据。 研究为受控实验的时间序列设计，分三阶段：热、热旱复合
ATLAS空间单细胞图谱比较五种小鼠脑转录组差异
结论：研究提出ATLAS组织图谱方法，并在小鼠脑中以空间单细胞分辨率检出不同遗传背景与性别间的细胞类型分布和区域组成差异；属方法学与描述性证据，提示存在差异但不足以下功能结论。 设计：方法开发加验证性观察研究；以小鼠脑为对象，将ATLAS细胞类型推断与MERFISH标记基因直接测
TOMM5与口腔癌进展：从单细胞图谱到体外验证的多组学分析
结论：多组学分析与体外实验提示，TOMM5在口腔癌组织中高表达，并与肿瘤进展、免疫浸润减少及部分药物敏感性相关；证据档位为C，主要为生信关联加细胞水平功能实验，尚不足以下因果结论。 设计：生物信息学分析结合体外实验：利用全球RNA-seq与芯片数据集分析表达谱与临床意义，用scR
StarTrak：单像素分辨率空间基因组学的体细胞变异识别与谱系重建
结论方向：作者提出并应用StarTrak框架，在单像素空间分辨率下整合体细胞突变证据推断细胞迁移与谱系树；属方法学预印本，证据档位C，尚不足以作为临床或生物学定论。 设计：为方法学开发与示例应用，非人群对照研究；材料未报告样本量、随访时长与对照设置。框架整合核与线粒体reads的
应激冻结样反应抵抗力的特质性血清蛋白质组特征：20对20对照研究
在生态效度较高的模拟武装袭击情境中，有经验的快速反应警员对冻结样反应（面对攻击时无反应）的抵抗程度明显高于未受训个体；作者据此提示，这种抵抗可能与稳定的特质性血清蛋白质组特征相关，而非急性应激反应过程。 采用非靶向血清蛋白质组学比较两组人群：未受训个体20例与有经验的警察快速反应
