从预测的细菌素到生态功能
综述指出基因组与宏基因组挖掘已发现大量预测细菌素位点，但其生态学解释明显滞后。 以细菌素为模型讨论抗菌基因预测的普遍问题：序列仅提示编码潜力，不能确立表达、产物部署、靶点结合或群落后果。
Scanpy：Python 单细胞基因表达数据分析工具包
Scanpy 是与 anndata 共同构建的单细胞基因表达数据分析工具包，覆盖预处理、可视化、聚类、轨迹推断与差异表达检验。
基于单细胞长读长的X染色体失活逃逸与偏倚解析女性免疫基因剂量
结论：作者提出基于图的单细胞长读长框架scDaisyChain，可在单个女性供者中重建X染色体单倍型，并据此量化谱系特异的XCI逃逸、偏倚与变异暴露，提示这些指标与性别偏倚的免疫基因剂量及X连锁变异暴露相关（预印本，证据档位C，方向为关联性描述）。 设计与做法：方法学研究加小规模
单细胞状态转变的可解释球面几何：主导主成分投影
研究提出SPHERE-PCA方法，将单细胞基因表达的主导主成分投影到单位球面，以获得可解释的坐标系统。 方法对前三个主成分坐标做L2归一化，将生物学定义的根节点对齐北极，用测地距离θ、角位置φ与投影前径向幅度r表示每个细胞。
ColabFold：基于Colab的蛋白质结构预测工具
ColabFold通过Google Colab提供蛋白质折叠预测，整合MMseqs2快速同源搜索与AlphaFold2等模型，降低使用门槛。
大鼠高低温跑能力品系骨骼肌增强子图谱与心肺适能遗传基础
结论方向：骨骼肌远端增强子的差异活性与遗传性心肺适能（CRF）差异相关，高跑能力（HCR）与低跑能力（LCR）品系间存在分布式增强子调控架构；证据来自预印本，档位为C，属提示性而非确证性结论。 研究设计与做法：整合128只经选择性繁育的遗传异质性大鼠（HCR与LCR）骨骼肌的54
重析应激颗粒转录组提示线粒体RNA富集
重新分析公开人类应激颗粒转录组后，提示其中可能存在线粒体RNA富集。 研究整合多种应激条件、细胞类型与分离策略的公开数据，比较差速离心与邻近标记结果。
单细胞可视化蛋白质组学揭示最小细菌基因表达机器结构协调
证据支持：该研究以单细胞可视化蛋白质组学手段，在最小细菌中观察到基因表达机器之间存在结构层面的协调关系，方向为正向关联，但材料仅给出标题与出处，强度无法量化。 研究设计与做法：材料未报告。仅知为发表于 Cell 的资讯条目，在线日期为 2026 年 9 月 25 日，作者包括 J
minimap2：面向长读长与剪接序列的通用比对工具
minimap2 是一个将 DNA 或 mRNA 序列比对到大型参考数据库的通用序列比对程序，支持长读长、剪接感知比对、重叠检测与组装比对等多种场景。
星形胶质细胞sEH-EET信号调控小胶质细胞溶酶体与STING通路（小鼠与iPSC研究）
在5xFAD小鼠中遗传性敲除sEH可减少I型干扰素应答的小胶质细胞亚群并降低pSTING水平，星形胶质细胞特异性而非内皮特异性sEH敲除可重现该表型；结果提示星形胶质细胞sEH-EET轴调控小胶质细胞STING信号，但证据来自预印本动物与细胞模型。 设计为多组学与遗传学干预研究：
