脓肿分枝杆菌碳饥饿诱导非复制状态及广泛蛋白质组重塑
结论方向：在体外碳饥饿（CS）模型中，脓肿分枝杆菌（Mab）进入非复制持留状态并伴随广泛的蛋白质组重塑，约三分之一可鉴定蛋白丰度发生显著变化，证据档位为C，属提示性基础研究证据。 研究设计与做法：采用Mab参考株ATCC 19977，建立碳饥饿持留模型，比较复制状态与非复制状态的
菌株分辨代谢组化学分型鉴定色氨酸与γ-谷氨酰肽为MGO-AGEs断裂后生元化合物
研究建立菌株分辨活性代谢组学框架，用于理性筛选具有MGO-AGEs断裂活性的后生元提取物以缓解羰基应激。 对来自113株细菌的177份胞内代谢物提取物进行非靶向代谢谱分析与体外MGO-AGEs断裂活性筛选，并开展菌株水平化学型比较分析。
肝内胆管癌：三级淋巴结构异质性的时空图谱（214 + 155 例 + 空间多组学）
Science Advances · 2026-09-09 · 期刊论文 肝内胆管癌（iCCA）预后极差、治疗选择有限。本研究构建了三级淋巴结构（TLS）的 多模态空间图谱 ，确认 肿瘤内 TLS（iTLS）为独立预后标志物 。 蛋白组学：
BCL10缺陷患者造血干细胞移植后的长期免疫重建
结论：作者报告一例携带新型纯合BCL10变异的BCL10缺陷患者，在造血干细胞移植后获得持久治愈与免疫重建；属单例观察，证据档位为C，不足以下结论认为该疗法对全部BCL10缺陷患者普遍有效。 设计：单例病例报告，患者为BCL10缺陷所致联合免疫缺陷，接受造血干细胞移植并随访观察免
溃疡性结肠炎FXR与肠道干性炎症研究的更正说明
该文为更正声明，针对已发表溃疡性结肠炎转录组学研究中若干结果表述进行澄清。 读者就单细胞RNA测序数据来源与分组呈现提出疑问，作者据此对材料方法及结果描述作出说明。
OSA缺氧与代谢重编程及动脉粥样硬化致病网络与候选生物标志物分析
基于转录组与单细胞数据的探索性分析提示，阻塞性睡眠呼吸暂停（OSA）中C17ORF91、HBEGF、PGBD2、ZNF616四个枢纽基因与缺氧反应、动脉粥样硬化及代谢重编程通路相关，但证据尚不足以确立其生物标志物地位。 研究为公共数据集二次分析：RNA-seq数据集GSE7509
144例肝内胆管癌基因组与空间免疫图谱揭示TIGIT相关免疫活化亚型
在144例肝内胆管癌（iCCA）队列中，整合转录组、DNA panel测序与多重免疫组化分析显示，免疫检查点调控呈明显的情境依赖性异质性；TIGIT可界定一个免疫活化亚型，提示其作为分层生物标志物的可能，但证据档位为C，尚不足以下临床结论。 研究为单队列观察性分子与空间免疫图谱分
GWAS与基因编辑解析紫花苜蓿MsCBF8-MsGolS2耐旱调控模块
该研究提示，MsCBF8作为耐旱正调控因子，通过直接结合MsGolS2启动子GCCGAC顺式元件激活其表达，过表达可增强苜蓿耐旱性且不损害生长，但结论主要来自同源四倍体背景下的遗传与生理实验。 设计为遗传学功能研究：在苜蓿中开展全基因组关联分析（GWAS）鉴定出CBF/DREB1
GCB-DLBCL高CNV暗区恶性细胞状态与不良预后
在GCB-DLBCL中，单细胞与批量转录组整合分析识别出一个高拷贝数变异（CNV）、富集暗区样程序的恶性细胞状态M-C2，其丰度升高与总生存期较差相关，并伴抗原呈递能力下降。 研究整合单细胞转录组与推断CNV分析刻画恶性B细胞状态，采用调控子分析、功能注释与scPAGWAS探讨调
血浆蛋白组学对新诊断原发中枢神经系统淋巴瘤的预后分层
在新诊断原发中枢神经系统淋巴瘤（PCNSL）患者中，基于基线血浆蛋白组学可划分出两种蛋白组状态，其中炎症型状态与更短的总生存和无进展生存相关，提示其可能具有预后分层价值。 研究为预后标志物开发与验证设计，纳入法国LOC网络162例新诊断PCNSL患者基线血浆，训练集84例、测试集
