脂肪酶ITB 2.1的结构与功能验证模型用于抗肥胖药物筛选
研究整合序列分析、结构建模、分子对接、分子动力学模拟与酶学实验，解析脂肪酶ITB 2.1的进化保守性及奥利司他对该酶的抑制机制。 采用多序列比对、系统发育与距离分析、分子对接和动力学模拟，并结合酶学测定，比较细菌、真菌与哺乳动物脂肪酶的结构特征。
SKQ1作为美罗培南增效剂对抗产NDM-1大肠埃希菌的体外研究
SKQ1经筛选被鉴定为可与美罗培南协同、用于对抗产NDM-1大肠埃希菌的潜在增效剂。 通过表面等离子共振筛选发现SKQ1，并以肉汤微量稀释棋盘法检测其与美罗培南的联合作用。
基于结构的虚拟筛选与分子动力学识别靶向肉毒神经毒素的新型金属蛋白酶抑制剂
研究以BoNT/A催化域为靶点，通过药物库的基于结构虚拟筛选与分子动力学模拟寻找新型金属蛋白酶抑制剂。 BoNT/A催化域与嗜热菌蛋白酶结构特征及锌依赖活性相似，为靶向相关蛋白酶机制的设计提供基础。
木犀草素经ERK1/2-GATA4通路抑制氧化应激与EndMT改善心肌纤维化
研究提示木犀草素可能通过ERK1/2-GATA4通路抑制氧化应激与内皮间质转化，减轻心肌纤维化。 大鼠经皮下注射异丙肾上腺素7天诱导心肌纤维化，随后给予木犀草素处理。
深度学习与分子模拟预测HDAC8抑制剂活性
研究构建并验证了一套深度学习计算流程，用于预测HDAC8抑制剂的活性强度。 整合化学信息学、神经网络、分子对接与分子动力学模拟，基于ChEMBL中4583个HDAC8抑制剂实验pIC50数据建模。
多维虚拟筛选与动力学模拟发现新型TRPV1拮抗剂及其机制分析
通过多维虚拟筛选结合动力学模拟，识别出新型TRPV1拮抗剂并分析其作用机制。 摘要仅为期刊出版信息，未说明筛选流程、化合物数量或模拟参数等设计细节。
大语言模型用于药物发现：应用与未来方向的系统综述
系统综述梳理大语言模型在药物研发各阶段的应用现状与未来方向。 遵循PRISMA 2020规范，检索2018至2025年PubMed、Scopus、Web of Science与Google Scholar文献。
来那度胺用于难治性白塞病：系统综述与计算药理学探索
该研究提示来那度胺重定位用于难治性白塞病是具有前景的策略，但结论基于临床病例与计算分析。 研究纳入临床病例报告的系统综述，并采用毒理预测、网络药理学筛选共同靶点、蛋白互作网络构建及分子对接等计算手段。
DHA-水杨醛-查尔酮-1,2,3-三唑杂合物的合成与α-葡萄糖苷酶抑制研究
结论：合成的DHA-水杨醛-查尔酮-三唑杂合物在体外显示α-葡萄糖苷酶抑制活性，其中4k最强。 设计：合成并表征系列杂合物4a-4l，行体外α-葡萄糖苷酶抑制测定，并以计算机模拟佐证。
交联位点位置对聚合物网络拓扑结构与力学性能影响的分子动力学模拟
结论：交联位点位置影响聚合物网络的拓扑结构，并进而改变其力学响应。 设计：采用分子动力学模拟，考察交联位点位置、位点间距与交联密度对网络的影响。
机器学习筛选天然BACE1抑制剂并作酶与细胞验证
构建机器学习模型用于发现天然BACE1抑制剂，并开展酶学与细胞水平验证。 基于朴素贝叶斯与递归划分算法建立九个BACE1抑制剂预测模型，并进行内外部验证。
ZnO纳米颗粒粒径对防晒性能及皮肤脂质相互作用的实验与分子动力学研究
研究提示ZnO纳米颗粒粒径可影响防晒配方的SPF及与角质层的分子层面相互作用。 实验测定不同粒径ZnO配方的防晒性能，并用分子动力学模拟表征ZnO与角质层的相互作用。
构象驱动设计合成新型PAK1抑制剂下调PD-L1用于三阴性乳腺癌
该研究基于构象驱动设计并合成新型PAK1抑制剂，旨在下调PD-L1以治疗三阴性乳腺癌。 作者包括Bao、Lai、Zhao等，刊于European Journal of Medicinal Chemistry第320卷。
双噁二唑类α-淀粉酶与α-葡萄糖苷酶配体的设计合成及计算评价
研究设计并合成双噁二唑衍生物，评估其作为α-葡萄糖苷酶和α-淀粉酶抑制剂的抗糖尿病潜力。 通过多步有机合成制备目标化合物，用FTIR、NMR、HRMS确证结构，并开展体外酶抑制实验及DFT、分子对接与ADME计算研究。
暗蛋白质组及其功能表征与药物发现的新兴技术
综述指出人类蛋白质组中仍有相当部分表征不足，即所谓暗蛋白质组，限制了对生物学功能与治疗潜力的认识。 文章梳理AI结构预测、冷冻电镜、功能基因组学与多组学等技术在探索暗蛋白质组方面的应用机会。
生物基前体合成非异氰酸酯聚氨酯用双羟烷基氨基甲酸酯与双氨基甲酸酯
该文以生物基前体合成非异氰酸酯聚氨酯所需的双羟烷基氨基甲酸酯与双氨基甲酸酯。 摘要仅含出版信息，具体合成路线与表征方法未在摘要中呈现。
计算设计与优化中药化合物抑制大肠杆菌gyraseB
研究以计算手段筛选中药化合物库，寻找靶向大肠杆菌DNA旋转酶B亚基的潜在抑制剂。 针对PDB 6F86靶点，依次采用机器学习模型、药效团过滤、Lipinski规则评估、分子对接与MM/GBSA计算。
人工智能辅助先导化合物优化：计算进展与转化挑战
综述AI辅助先导化合物优化，关注计算进展与转化应用之间的衔接问题。 因摘要缺失，仅据标题推断为综述性文献，讨论计算方法与转化障碍两方面。
Boltz：生物分子相互作用预测模型
Boltz 是一系列开源模型，用于预测生物分子复合物结构及结合亲和力，支持早期药物发现中的虚拟筛选与先导优化。
新型TEAD抑制剂的设计合成及肝纤维化治疗评价
设计并合成新型TEAD抑制剂，并对其治疗肝纤维化的作用进行生物学评价。 摘要仅提供刊源与作者，未给出化合物结构、实验模型与对照设置。
