Cleistanthin A 及 diphyllin 衍生物作为推定 EGFR 结合化合物的计算与生物物理研究

Scientific Reports · 2026-10-25 · 期刊论文

• 一句话结论：结论：计算对接提示 Cleistanthin A 及其衍生物对野生型 EGFR 的对接评分优于厄洛替尼，表面等离子共振提示其与 EGFR 酪氨酸激酶存在浓度依赖性结合；作者据此提示芳基萘内酯木脂素可作为靶向 EGFR 的候选骨架，但尚不足以下结论认为其具有成药性或体内有效性。
• 研究设计与做法：设计与做法：研究为计算与生物物理结合的体外研究，无临床样本与随访；采用整合的计算机辅助药物设计流程，包括靶点预测（SwissTargetPrediction）、分子对接、分子动力学模拟、结合自由能计算与表面等离子共振；对接对象为非小细胞肺癌相关的可成药激酶，SPR 检测 CTA、MUC-853、MUC-858、Compound 1 与 Compound 2 与 EGFR-TK 的结合。
• 主要结果：主要结果：对接显示 CTA 及衍生物对野生型 EGFR 的评分优于厄洛替尼；MD 提示蛋白–配体复合物稳定；MM/PB(GB)SA 分析显示范德华相互作用是 ATP 结合口袋结合的主要驱动力，引入苯甲酰酯基团增加非极性结合能贡献；SPR 显示浓度依赖性结合，Compound 1 与 MUC-858 的解离常数较低，分别为 6.4 与 9.5 µM。
• 机制或解释：机制或解释：作者的解释是，这些化合物主要结合于 EGFR 的 ATP 结合口袋，结合以范德华等非极性相互作用为主导，苯甲酰酯基团的引入可增强非极性结合能贡献，从而改善亲和力相关的结构–相互作用特征。
• 局限与边界：局限与边界：证据主要来自计算预测与体外生物物理实验，缺乏细胞与体内功能验证；SPR 测得的解离常数处于微摩尔级，亲和力有限；材料未报告研究人群、随访、利益冲突等信息，结论外推至临床或体内情形不足以下结论。
• 可否落地：可否落地：对科研的含义是提示芳基萘内酯木脂素可作为 EGFR 结合化合物的设计骨架，为结构优化提供线索；对临床尚无直接含义。证据档位为 C，属「提示」级别，需细胞活性、选择性及体内研究进一步验证，当前不足以下结论。

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Bunnatut Panasawatwong, Duangporn Lohawittayanan, Napason Chabang 等

本文摘自《每日前沿研究简报 · 2026-10-27》「化学信息 / 药物发现」。本内容仅用于研究信息整理与科普交流，不构成医疗建议。