OSA缺氧与代谢重编程及动脉粥样硬化致病网络与候选生物标志物分析
基于转录组与单细胞数据的探索性分析提示，阻塞性睡眠呼吸暂停（OSA）中C17ORF91、HBEGF、PGBD2、ZNF616四个枢纽基因与缺氧反应、动脉粥样硬化及代谢重编程通路相关，但证据尚不足以确立其生物标志物地位。 研究为公共数据集二次分析：RNA-seq数据集GSE7509
GCB-DLBCL高CNV暗区恶性细胞状态与不良预后
在GCB-DLBCL中，单细胞与批量转录组整合分析识别出一个高拷贝数变异（CNV）、富集暗区样程序的恶性细胞状态M-C2，其丰度升高与总生存期较差相关，并伴抗原呈递能力下降。 研究整合单细胞转录组与推断CNV分析刻画恶性B细胞状态，采用调控子分析、功能注释与scPAGWAS探讨调
多模态MRI生境联合Transformer病理组学预测成人弥漫性胶质瘤高危分子亚型
结论方向：研究提示跨尺度联合模型对成人弥漫性胶质瘤高危分子亚型的预测表现优于单一MRI生境模型与病理深度学习模型，且模型风险分层与生存差异及细胞外基质相关转录特征存在关联；属回顾性建模研究。 研究设计与做法：回顾性收集456例成人弥漫性胶质瘤患者的术前MRI、术后全切片病理图像、
贝莱斯芽孢杆菌A5抑制烟草根腐病及真菌几丁质代谢基因表达
结论方向：A5菌株在平板对峙中对4种烟草根腐病相关镰刀菌表现广谱拮抗，并可影响病原菌UDP-N-乙酰葡糖胺相关代谢基因表达，提示其可能作为烟草根腐病生防候选资源；证据档位C，属实验室层面提示性结果。 研究设计与做法：从烟草根际分离100株细菌，用平板对峙法筛选获得广谱拮抗菌A5；
Chemerin-CMKLR1信号与盐敏感性高血压免疫代谢障碍
结论：在30例高血压成人的住院盐负荷/限盐方案中，血浆chemerin在限盐期升高并与盐敏感性及收缩压相关，提示chemerin-CMKLR1信号可能参与盐敏感性高血压的免疫代谢障碍，但证据档位为小样本观察性研究，不足以下因果结论。 设计与做法：研究为小样本住院盐敏感性方案，纳入
HIV-1 Vpr诱导原代CD4+ T细胞B细胞样表型
结论：多组学分析提示，HIV-1 Vpr可在原代CD4+ T细胞中诱导B细胞样转录程序，方向为促进B细胞相关基因表达；该发现属机制探索性结果，尚不足以推断临床意义。 研究设计与做法：采用整合多组学方法，在急性感染条件下识别HIV-1 RNA阳性CD4+ T细胞；通过Vpr过表达与
脓肿分枝杆菌碳饥饿诱导非复制状态及广泛蛋白质组重塑
结论方向：在体外碳饥饿（CS）模型中，脓肿分枝杆菌（Mab）进入非复制持留状态并伴随广泛的蛋白质组重塑，约三分之一可鉴定蛋白丰度发生显著变化，证据档位为C，属提示性基础研究证据。 研究设计与做法：采用Mab参考株ATCC 19977，建立碳饥饿持留模型，比较复制状态与非复制状态的
血浆蛋白组学对新诊断原发中枢神经系统淋巴瘤的预后分层
在新诊断原发中枢神经系统淋巴瘤（PCNSL）患者中，基于基线血浆蛋白组学可划分出两种蛋白组状态，其中炎症型状态与更短的总生存和无进展生存相关，提示其可能具有预后分层价值。 研究为预后标志物开发与验证设计，纳入法国LOC网络162例新诊断PCNSL患者基线血浆，训练集84例、测试集
硫源驱动IGTS8燃料脱硫菌基因表达全局重塑的RNA-seq研究
在燃料生物脱硫条件下，模式菌株Rhodococcus qingshengii IGTS8的转录组随硫源与生长阶段发生广泛重排，其中对数后期转录响应最强；作者据此提示该状态下的细胞优先维持稳态与保护，而非增殖。 采用时间序列比较RNA-seq设计，将IGTS8分别以二苯并噻吩（DB
GWAS与基因编辑解析紫花苜蓿MsCBF8-MsGolS2耐旱调控模块
该研究提示，MsCBF8作为耐旱正调控因子，通过直接结合MsGolS2启动子GCCGAC顺式元件激活其表达，过表达可增强苜蓿耐旱性且不损害生长，但结论主要来自同源四倍体背景下的遗传与生理实验。 设计为遗传学功能研究：在苜蓿中开展全基因组关联分析（GWAS）鉴定出CBF/DREB1
ProST：图像提示引导的多模态表征学习用于空间域识别
作者提出ProST框架，在多个空间转录组数据集上报告其在空间域识别、可视化、空间轨迹推断与基因表达填补方面一致优于现有方法；该结论基于作者自选数据集的基准比较，属方法学提示性证据，尚不足以断言普适优越性。 研究为计算方法的开发与基准评测，非临床研究。ProST以组织学图像作为图像
整合转录组与单细胞分析提示CD74为肾结石肾小管细胞铁死亡候选调控因子
研究提示CD74可能与肾结石中肾小管上皮细胞的铁死亡相关损伤有关，并可能涉及NF-κB信号通路。 采用乙醛酸诱导小鼠模型，结合批量转录组、蛋白互作与单细胞分析，观察草酸钙沉积、肾功能及铁死亡相关指标变化。
成纤维细胞相关TPM2连接细胞基质重塑与肝内胆管癌吉西他滨耐药
成纤维细胞相关TPM2可能将细胞基质重塑与EMT-Notch信号及吉西他滨耐药相联系。 整合4个单细胞RNA测序数据集共50176个细胞，并结合TCGA转录组与药敏分析。
溃疡性结肠炎FXR与肠道干性炎症研究的更正说明
该文为更正声明，针对已发表溃疡性结肠炎转录组学研究中若干结果表述进行澄清。 读者就单细胞RNA测序数据来源与分组呈现提出疑问，作者据此对材料方法及结果描述作出说明。
MPXV Ib与IIb分支在BALB/c小鼠模型中的致病差异及抗病毒治疗结局
BALB/c小鼠模型显示，MPXV Ib分支的致病性强于IIb分支，且两者抗病毒治疗结局存在差异。 建立鼻内接种MPXV Ib的BALB/c小鼠模型，并与IIb分支比较致病性及抗病毒治疗反应。
柠檬肠梭菌及相关肠道菌群物种通过产生生物活性小分子调控霍乱弧菌生物膜形成
肠道共生菌柠檬肠梭菌及相关菌群物种可通过产生生物活性小分子调控霍乱弧菌生物膜形成。 研究以人粪便有机提取物观察霍乱弧菌基因表达，并用柠檬肠梭菌纯培养提取物进行验证。
卒中后抑郁严重度特异的炎症与代谢特征多组学分析
研究提示卒中后抑郁不同严重度伴随特异的肠道菌群、代谢与炎症特征。 对91例不同严重度卒中后抑郁患者及非抑郁对照行宏基因组、非靶向代谢组与血清细胞因子检测。
菌株分辨代谢组化学分型鉴定色氨酸与γ-谷氨酰肽为MGO-AGEs断裂后生元化合物
研究建立菌株分辨活性代谢组学框架，用于理性筛选具有MGO-AGEs断裂活性的后生元提取物以缓解羰基应激。 对来自113株细菌的177份胞内代谢物提取物进行非靶向代谢谱分析与体外MGO-AGEs断裂活性筛选，并开展菌株水平化学型比较分析。
稻瘟病菌种复合体：宿主专一化的"受限可塑性"框架
背景：稻瘟病威胁全球水稻生产，小麦瘟的出现说明该病原具备宿主跳跃能力；Magnaporthe oryzae 并非均一种，而是遗传分化、宿主适应的谱系复合体。 框架：整合演化基因组学、转录组学与代谢组学，提出"受限可塑性（Constrained Plasticity）"，认为宿主适
非小细胞肺癌：TXNRD1 经 TGF-β1 自分泌环驱动细胞可塑性与干性
数据挖掘：在 TCGA 与 GEO 中分析分期进展相关基因谱（侧重氧化还原基因家族）；TCGA 显示 TXNRD1 在晚期 NSCLC 中表达约为 2 倍，并在肿瘤组织中验证。 细胞实验：在 A549、H226、H1299 中过表达或敲低 TXNRD1（CRISPR/Cas9 或
