衰老脑跨调控图谱:TransMap多尺度细胞类型解析(预印本,平均N=476供体)

生命科学 2026-11-10 19 阅读

medRxiv · 2026-11-08 · 预印本

  • 一句话结论:提示TransMap可提升弱效应远端调控变异的检出能力,并构建衰老脑细胞类型解析的跨调控图谱;为预印本计算研究,证据档位C,证据支持限于方法学性能,生物学发现不足以下结论。
  • 研究设计与做法:研究设计:计算框架开发加真实数据应用;模拟实验评估效能与I类错误,应用于ADSP FunGen-AD联盟衰老脑bulk与单核转录组,整合蛋白、糖蛋白与代谢组标志物(平均N=476供体),并做共培养与空间转录组验证。
  • 主要结果:主要结果:模拟中跨QTL发现效能较现有方法提高9.2%–36.7%且I类错误受控;精细定位变异注释在57种复杂疾病/性状(平均N=307K)中遗传力富集2.75–2.88倍;多表型共定位识别49,532个跨调控事件、1,825个候选cis-trans-标志物构型,AD相关115个位点。
  • 机制或解释:机制或解释:作者提出局部共调控程序表型可吸收背景表达变异,从而捕捉微弱协同的远端遗传效应;并报告神经元cis信号与胶质跨调控反应之间的不对称跨细胞类型结构。
  • 局限与边界:局限与边界:为预印本未经同行评议;跨QTL效应弱、多重检验负担重、可重复性有限;供体样本量与人群构成、随访时长及利益冲突材料未报告。
  • 可否落地:可否落地:方法学层面证据支持其作为跨调控变异发现工具,生物学与疾病关联层面仅为提示;临床落地不足以下结论,需独立队列复现与实验验证。

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Xuewei Cao, Yifei Wang, Haochen Sun 等


本文摘自《每日前沿研究简报 · 2026-11-10》「生物信息 / 组学(单细胞·差异表达)」。本内容仅用于研究信息整理与科普交流,不构成医疗建议。

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