DirectClean：面向Nanopore直接cDNA转录组测序的伪影识别预处理与读段挽救框架
结论：DirectClean在直接cDNA转录组数据中较Pychopper保留更多读段与碱基，并降低嵌合读段比例，提示其可提升下游异构体与融合分析的可靠性；属工具开发类证据。 设计：方法学开发与基准评测，在4套直接cDNA数据集上与Pychopper比较，并行半合成验证与真实数据
非甲烷挥发性有机物排放负担与慢性肾病的关联：流行病学、转录组与体外整合分析
该研究提示省级非甲烷挥发性有机物（NMVOC）排放负担与慢性肾病（CKD）之间存在关联信号，并给出候选分子通路，但因果性不足以下结论。 设计为整合流行病学、转录组、单细胞与体外实验的分析；流行病学部分将省级NMVOC排放负担按居住省份匹配至中国健康与养老追踪调查（CHARLS）的
犬慢性肠病粪便微生物组聚类分型与代谢谱及治疗结局差异
在犬慢性肠病（CE）队列中，基于粪便微生物组的无监督聚类可区分出两个亚型；其中Cluster 2表现为菌群失调，且该亚型在基线CCECAI>3的犬中治疗后缓解比例低于Cluster 1，提示微生物组分型可能与治疗结局相关。 研究为横断面取样加治疗前后对比的观察性设计：纳入CE犬5
NBAS缺陷致IFN信号过度激活引发免疫失调的四例病例研究
结论：证据提示NBAS缺陷可导致以髓系细胞驱动的I型干扰素病为特征的免疫失调，属病例层面的机制性发现，尚不足以外推为普遍结论。 设计：病例系列研究，纳入4例携带5种NBAS功能缺失突变的患者，采用微小基因（minigene）试验与RNA分析评估剪接异常，并行转录组与单细胞RNA测
FMOD标记前列腺癌低恶性上皮状态：基于TCGA构建四基因ECM预后特征并作单细胞与功能验证
研究基于TCGA-PRAD数据构建4基因细胞外基质相关基因预后特征，用于预测无病间期；其中枢纽基因FMOD保护作用最强，虽在肿瘤组织中总体表达更高，却预示更好的临床结局，并在体外敲低实验中表现为抑制增殖。该结果属「提示」档位，尚需前瞻性验证。 研究为预后标志物开发与验证研究：利用
转座子来源嵌合RNA的结构与功能图景：分类、生成机制与生理病理作用（综述）
结论：该综述提出转座子（TE）来源嵌合RNA是转录组创新、进化适应与疾病病因的重要驱动因素，属综述层面的整合性判断，非原始实验证据。 设计：叙述性综述，系统梳理TE来源嵌合RNA的结构与功能图景，将其分为TE-编码基因嵌合、TE-lncRNA嵌合与TE-TE嵌合三类；未涉及样本量
TOMM5与口腔癌进展：从单细胞图谱到体外验证的多组学分析
结论：多组学分析与体外实验提示，TOMM5在口腔癌组织中高表达，并与肿瘤进展、免疫浸润减少及部分药物敏感性相关；证据档位为C，主要为生信关联加细胞水平功能实验，尚不足以下因果结论。 设计：生物信息学分析结合体外实验：利用全球RNA-seq与芯片数据集分析表达谱与临床意义，用scR
应激冻结样反应抵抗力的特质性血清蛋白质组特征：20对20对照研究
在生态效度较高的模拟武装袭击情境中，有经验的快速反应警员对冻结样反应（面对攻击时无反应）的抵抗程度明显高于未受训个体；作者据此提示，这种抵抗可能与稳定的特质性血清蛋白质组特征相关，而非急性应激反应过程。 采用非靶向血清蛋白质组学比较两组人群：未受训个体20例与有经验的警察快速反应
绿色合成辣椒源MgO纳米颗粒对耐多药溶血葡萄球菌生物膜及MCF-7细胞的影响
结论：辣椒提取物介导合成的MgO纳米颗粒（CAE/MgONPs）在体外可降低部分耐多药溶血葡萄球菌分离株的生物膜生物量，并浓度依赖地降低MCF-7细胞活力；但抗生物膜与转录调控效应呈菌株依赖性，方向不一致，证据档位为C，尚不足以下结论。 设计：体外实验研究。自20份血液标本分离出
144例肝内胆管癌基因组与空间免疫图谱揭示TIGIT相关免疫活化亚型
在144例肝内胆管癌（iCCA）队列中，整合转录组、DNA panel测序与多重免疫组化分析显示，免疫检查点调控呈明显的情境依赖性异质性；TIGIT可界定一个免疫活化亚型，提示其作为分层生物标志物的可能，但证据档位为C，尚不足以下临床结论。 研究为单队列观察性分子与空间免疫图谱分
