标签:生物信息 组学

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木寡糖添加对泌乳泽西牛甲烷排放、瘤胃菌群与血清代谢组的影响

作者在48头泌乳泽西牛中比较木寡糖(XOS)添加与不添加,报告XOS组甲烷排放降低、瘤胃菌群观测物种数与ACE指数升高;方向为减排与菌群丰富度提升,但每组仅3头牛进入检测分析,证据档位为C,提示性而非确证性。 设计为随机对照饲喂试验,48头泽西牛随机分为XOS组(T组,25 g/

血浆蛋白组学对新诊断原发中枢神经系统淋巴瘤的预后分层

在新诊断原发中枢神经系统淋巴瘤(PCNSL)患者中,基于基线血浆蛋白组学可划分出两种蛋白组状态,其中炎症型状态与更短的总生存和无进展生存相关,提示其可能具有预后分层价值。 研究为预后标志物开发与验证设计,纳入法国LOC网络162例新诊断PCNSL患者基线血浆,训练集84例、测试集

HIV-1 Vpr诱导原代CD4+ T细胞B细胞样表型

结论:多组学分析提示,HIV-1 Vpr可在原代CD4+ T细胞中诱导B细胞样转录程序,方向为促进B细胞相关基因表达;该发现属机制探索性结果,尚不足以推断临床意义。 研究设计与做法:采用整合多组学方法,在急性感染条件下识别HIV-1 RNA阳性CD4+ T细胞;通过Vpr过表达与

贝莱斯芽孢杆菌A5抑制烟草根腐病及真菌几丁质代谢基因表达

结论方向:A5菌株在平板对峙中对4种烟草根腐病相关镰刀菌表现广谱拮抗,并可影响病原菌UDP-N-乙酰葡糖胺相关代谢基因表达,提示其可能作为烟草根腐病生防候选资源;证据档位C,属实验室层面提示性结果。 研究设计与做法:从烟草根际分离100株细菌,用平板对峙法筛选获得广谱拮抗菌A5;

多模态MRI生境联合Transformer病理组学预测成人弥漫性胶质瘤高危分子亚型

结论方向:研究提示跨尺度联合模型对成人弥漫性胶质瘤高危分子亚型的预测表现优于单一MRI生境模型与病理深度学习模型,且模型风险分层与生存差异及细胞外基质相关转录特征存在关联;属回顾性建模研究。 研究设计与做法:回顾性收集456例成人弥漫性胶质瘤患者的术前MRI、术后全切片病理图像、

Metabonaut:面向可重复脚本化非靶向LC-MS/MS代谢组学的开放教育资源

该教育性综述提出,非靶向LC-MS/MS代谢组学中从原始文件到特征表的分析流程难以共享、审计与复用,并以开放教育资源Metabonaut为例,展示如何将FAIR原则从数据延伸至分析流程,属方法学与教育层面的论述而非实证疗效研究。 研究类型为教育性综述,基于R for Mass S

GWAS与基因编辑解析紫花苜蓿MsCBF8-MsGolS2耐旱调控模块

该研究提示,MsCBF8作为耐旱正调控因子,通过直接结合MsGolS2启动子GCCGAC顺式元件激活其表达,过表达可增强苜蓿耐旱性且不损害生长,但结论主要来自同源四倍体背景下的遗传与生理实验。 设计为遗传学功能研究:在苜蓿中开展全基因组关联分析(GWAS)鉴定出CBF/DREB1