标签:生物信息 组学

该标签下的全部条目(栏目名、期号「YYYY-MM-DD」与「每日前沿」都会作为标签)。

GWAS与基因编辑解析紫花苜蓿MsCBF8-MsGolS2耐旱调控模块

该研究提示,MsCBF8作为耐旱正调控因子,通过直接结合MsGolS2启动子GCCGAC顺式元件激活其表达,过表达可增强苜蓿耐旱性且不损害生长,但结论主要来自同源四倍体背景下的遗传与生理实验。 设计为遗传学功能研究:在苜蓿中开展全基因组关联分析(GWAS)鉴定出CBF/DREB1

DirectClean:面向Nanopore直接cDNA转录组测序的伪影识别预处理与读段挽救框架

结论:DirectClean在直接cDNA转录组数据中较Pychopper保留更多读段与碱基,并降低嵌合读段比例,提示其可提升下游异构体与融合分析的可靠性;属工具开发类证据。 设计:方法学开发与基准评测,在4套直接cDNA数据集上与Pychopper比较,并行半合成验证与真实数据

犬慢性肠病粪便微生物组聚类分型与代谢谱及治疗结局差异

在犬慢性肠病(CE)队列中,基于粪便微生物组的无监督聚类可区分出两个亚型;其中Cluster 2表现为菌群失调,且该亚型在基线CCECAI>3的犬中治疗后缓解比例低于Cluster 1,提示微生物组分型可能与治疗结局相关。 研究为横断面取样加治疗前后对比的观察性设计:纳入CE犬5

GCB-DLBCL高CNV暗区恶性细胞状态与不良预后

在GCB-DLBCL中,单细胞与批量转录组整合分析识别出一个高拷贝数变异(CNV)、富集暗区样程序的恶性细胞状态M-C2,其丰度升高与总生存期较差相关,并伴抗原呈递能力下降。 研究整合单细胞转录组与推断CNV分析刻画恶性B细胞状态,采用调控子分析、功能注释与scPAGWAS探讨调