HIV-1 Vpr诱导原代CD4+ T细胞B细胞样表型
结论：多组学分析提示，HIV-1 Vpr可在原代CD4+ T细胞中诱导B细胞样转录程序，方向为促进B细胞相关基因表达；该发现属机制探索性结果，尚不足以推断临床意义。 研究设计与做法：采用整合多组学方法，在急性感染条件下识别HIV-1 RNA阳性CD4+ T细胞；通过Vpr过表达与
绿色合成辣椒源MgO纳米颗粒对耐多药溶血葡萄球菌生物膜及MCF-7细胞的影响
结论：辣椒提取物介导合成的MgO纳米颗粒（CAE/MgONPs）在体外可降低部分耐多药溶血葡萄球菌分离株的生物膜生物量，并浓度依赖地降低MCF-7细胞活力；但抗生物膜与转录调控效应呈菌株依赖性，方向不一致，证据档位为C，尚不足以下结论。 设计：体外实验研究。自20份血液标本分离出
TOMM5与口腔癌进展：从单细胞图谱到体外验证的多组学分析
结论：多组学分析与体外实验提示，TOMM5在口腔癌组织中高表达，并与肿瘤进展、免疫浸润减少及部分药物敏感性相关；证据档位为C，主要为生信关联加细胞水平功能实验，尚不足以下因果结论。 设计：生物信息学分析结合体外实验：利用全球RNA-seq与芯片数据集分析表达谱与临床意义，用scR
硫源驱动IGTS8燃料脱硫菌基因表达全局重塑的RNA-seq研究
在燃料生物脱硫条件下，模式菌株Rhodococcus qingshengii IGTS8的转录组随硫源与生长阶段发生广泛重排，其中对数后期转录响应最强；作者据此提示该状态下的细胞优先维持稳态与保护，而非增殖。 采用时间序列比较RNA-seq设计，将IGTS8分别以二苯并噻吩（DB
单细胞与空间图谱揭示弥漫性胶质瘤IDH相关恶性与免疫结构差异
基于69例肿瘤的单细胞、单核与空间转录组图谱，研究提示IDH状态与恶性细胞状态构成及免疫浸润格局相关：IDH突变型以分化谱系样状态为主且免疫浸润减少，而GBM中ALPC与缺氧状态扩增并伴髓系、淋系浸润增加。 研究为肿瘤样本的分子图谱分析，采用scRNA-seq、snRNA-seq
GWAS与基因编辑解析紫花苜蓿MsCBF8-MsGolS2耐旱调控模块
该研究提示，MsCBF8作为耐旱正调控因子，通过直接结合MsGolS2启动子GCCGAC顺式元件激活其表达，过表达可增强苜蓿耐旱性且不损害生长，但结论主要来自同源四倍体背景下的遗传与生理实验。 设计为遗传学功能研究：在苜蓿中开展全基因组关联分析（GWAS）鉴定出CBF/DREB1
DirectClean：面向Nanopore直接cDNA转录组测序的伪影识别预处理与读段挽救框架
结论：DirectClean在直接cDNA转录组数据中较Pychopper保留更多读段与碱基，并降低嵌合读段比例，提示其可提升下游异构体与融合分析的可靠性；属工具开发类证据。 设计：方法学开发与基准评测，在4套直接cDNA数据集上与Pychopper比较，并行半合成验证与真实数据
成纤维细胞相关TPM2连接细胞基质重塑与肝内胆管癌吉西他滨耐药
成纤维细胞相关TPM2可能将细胞基质重塑与EMT-Notch信号及吉西他滨耐药相联系。 整合4个单细胞RNA测序数据集共50176个细胞，并结合TCGA转录组与药敏分析。
柠檬肠梭菌及相关肠道菌群物种通过产生生物活性小分子调控霍乱弧菌生物膜形成
肠道共生菌柠檬肠梭菌及相关菌群物种可通过产生生物活性小分子调控霍乱弧菌生物膜形成。 研究以人粪便有机提取物观察霍乱弧菌基因表达，并用柠檬肠梭菌纯培养提取物进行验证。
犬慢性肠病粪便微生物组聚类分型与代谢谱及治疗结局差异
在犬慢性肠病（CE）队列中，基于粪便微生物组的无监督聚类可区分出两个亚型；其中Cluster 2表现为菌群失调，且该亚型在基线CCECAI>3的犬中治疗后缓解比例低于Cluster 1，提示微生物组分型可能与治疗结局相关。 研究为横断面取样加治疗前后对比的观察性设计：纳入CE犬5
