HIV-1 Vpr诱导原代CD4+ T细胞B细胞样表型
结论：多组学分析提示，HIV-1 Vpr可在原代CD4+ T细胞中诱导B细胞样转录程序，方向为促进B细胞相关基因表达；该发现属机制探索性结果，尚不足以推断临床意义。 研究设计与做法：采用整合多组学方法，在急性感染条件下识别HIV-1 RNA阳性CD4+ T细胞；通过Vpr过表达与
绿色合成辣椒源MgO纳米颗粒对耐多药溶血葡萄球菌生物膜及MCF-7细胞的影响
结论：辣椒提取物介导合成的MgO纳米颗粒（CAE/MgONPs）在体外可降低部分耐多药溶血葡萄球菌分离株的生物膜生物量，并浓度依赖地降低MCF-7细胞活力；但抗生物膜与转录调控效应呈菌株依赖性，方向不一致，证据档位为C，尚不足以下结论。 设计：体外实验研究。自20份血液标本分离出
TOMM5与口腔癌进展：从单细胞图谱到体外验证的多组学分析
结论：多组学分析与体外实验提示，TOMM5在口腔癌组织中高表达，并与肿瘤进展、免疫浸润减少及部分药物敏感性相关；证据档位为C，主要为生信关联加细胞水平功能实验，尚不足以下因果结论。 设计：生物信息学分析结合体外实验：利用全球RNA-seq与芯片数据集分析表达谱与临床意义，用scR
硫源驱动IGTS8燃料脱硫菌基因表达全局重塑的RNA-seq研究
在燃料生物脱硫条件下，模式菌株Rhodococcus qingshengii IGTS8的转录组随硫源与生长阶段发生广泛重排，其中对数后期转录响应最强；作者据此提示该状态下的细胞优先维持稳态与保护，而非增殖。 采用时间序列比较RNA-seq设计，将IGTS8分别以二苯并噻吩（DB
单细胞与空间图谱揭示弥漫性胶质瘤IDH相关恶性与免疫结构差异
基于69例肿瘤的单细胞、单核与空间转录组图谱，研究提示IDH状态与恶性细胞状态构成及免疫浸润格局相关：IDH突变型以分化谱系样状态为主且免疫浸润减少，而GBM中ALPC与缺氧状态扩增并伴髓系、淋系浸润增加。 研究为肿瘤样本的分子图谱分析，采用scRNA-seq、snRNA-seq
GWAS与基因编辑解析紫花苜蓿MsCBF8-MsGolS2耐旱调控模块
该研究提示，MsCBF8作为耐旱正调控因子，通过直接结合MsGolS2启动子GCCGAC顺式元件激活其表达，过表达可增强苜蓿耐旱性且不损害生长，但结论主要来自同源四倍体背景下的遗传与生理实验。 设计为遗传学功能研究：在苜蓿中开展全基因组关联分析（GWAS）鉴定出CBF/DREB1
成纤维细胞相关TPM2连接细胞基质重塑与肝内胆管癌吉西他滨耐药
成纤维细胞相关TPM2可能将细胞基质重塑与EMT-Notch信号及吉西他滨耐药相联系。 整合4个单细胞RNA测序数据集共50176个细胞，并结合TCGA转录组与药敏分析。
DirectClean：面向Nanopore直接cDNA转录组测序的伪影识别预处理与读段挽救框架
结论：DirectClean在直接cDNA转录组数据中较Pychopper保留更多读段与碱基，并降低嵌合读段比例，提示其可提升下游异构体与融合分析的可靠性；属工具开发类证据。 设计：方法学开发与基准评测，在4套直接cDNA数据集上与Pychopper比较，并行半合成验证与真实数据
原发中枢神经系统淋巴瘤分子病理与诊疗转化综述
该综述提示，整合液体活检与多组学分子分型可能推动原发中枢神经系统淋巴瘤（PCNSL）诊断精细化，并催生免疫调节剂、激酶抑制剂及CAR-T等新策略，但均处于转化探索阶段，尚不足以支持临床常规应用。 研究设计为叙述性综述，围绕PCNSL分子病理、临床相关分子亚分类、新兴治疗与下一代诊
肝纤维化中的转录因子：机制与纳米技术治疗策略综述
综述提出转录因子是肝纤维化中调控肝细胞命运、代谢稳态、炎症与细胞外基质重塑的关键节点，纳米载体可实现对转录因子的精准调控与肝内细胞选择性靶向；属叙述性综述层面的证据支持，非原始研究结论。 为综述，非原始实验；材料未报告纳入文献数量、检索策略与系统评价方法。内容涵盖肝细胞中HNF4
