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单细胞状态转变的可解释球面几何:主导主成分投影

研究提出SPHERE-PCA方法,将单细胞基因表达的主导主成分投影到单位球面,以获得可解释的坐标系统。 方法对前三个主成分坐标做L2归一化,将生物学定义的根节点对齐北极,用测地距离θ、角位置φ与投影前径向幅度r表示每个细胞。