网络药理学与计算模拟设计靶向PTP1B变构位点的simufilam类衍生物用于阿尔茨海默病神经保护
结论（计算预测层面）：基于网络药理学与分子模拟，衍生物A20被预测可结合PTP1B非竞争性变构位点，并显示较优的结合能、轨迹稳定性与类药性，作者据此将其定位为待实验验证的先导候选；该结论属计算预测，尚不足以作为疗效结论。 设计与做法：研究为纯计算机模拟研究，未涉及人体或动物实验。
SKQ1作为美罗培南增效剂对抗产NDM-1大肠埃希菌的体外研究
SKQ1经筛选被鉴定为可与美罗培南协同、用于对抗产NDM-1大肠埃希菌的潜在增效剂。 通过表面等离子共振筛选发现SKQ1，并以肉汤微量稀释棋盘法检测其与美罗培南的联合作用。
基于Kirkwood-Buff理论的分子动力学模拟计算多组分混合物水活度
该研究提示，将Kirkwood-Buff理论推广至任意独立热力学组分数目的多组分水溶液后，可由分子动力学轨迹估算水活度，计算结果再现了主要实验趋势，但属方法学探索，尚不足以作为定量标准。 设计为分子动力学模拟方法学研究：以KB理论为基础，采用广义公式对所需化学势导数进行数值求解，
CDK6结构导向药物重定位：319种非抗肿瘤药物的分子对接与动力学分析
通过分子对接与分子动力学模拟，度他雄胺、达那唑与氮卓斯汀被识别为可稳定占据CDK6 ATP结合位点的候选骨架，其中氮卓斯汀预测结合能最接近参照抑制剂阿贝西利；但均为计算预测，尚无生化或细胞层面证据支持其生物学相关性。 研究为计算结构生物学方法：以预测的人CDK6-Cyclin D
qcGEM：融合量子化学信息的图分子表征及83项任务评估
结论：作者提出一种融合量子化学先验的图分子表征qcGEM，并在83项分子相关任务上报告了优于现有方法的性能；该结论来自作者自评的基准比较，属计算研究层面的证据支持，尚不涉及湿实验或临床验证。 设计与做法：研究为方法学开发与基准评测，非人体或动物实验。作者设计专门模型架构处理量子化
AI引导发现真菌麦角甾醇衍生物作为选择性LXRβ激动剂靶向胶质母细胞瘤胆固醇依赖
研究以人工智能引导策略发现真菌麦角甾醇衍生物，作为靶向胶质母细胞瘤胆固醇依赖的选择性LXRβ激动剂。 针对GBM对外源胆固醇的共同依赖及LXRβ作为中枢神经系统胆固醇外排主要调控因子，构建整合性AI方法筛选LXRβ选择性、可透过血脑屏障且避免LXRα共激活肝毒性的激动剂。
基于网络药理学与转录组学筛选药食同源植物中AML预后基因及候选治疗靶点
结论（方向与强度）：通过网络药理学与转录组学整合分析，从106种药食同源植物中筛出候选基因与核心活性成分，并识别出6个AML潜在预后基因；证据属生物信息学预测与体外表达验证层面，尚不足以支持临床疗效结论。 研究设计与做法：材料未报告研究类型的具体界定；做法为系统分析AML公共组学
暗蛋白质组及其功能表征与药物发现的新兴技术
综述指出人类蛋白质组中仍有相当部分表征不足，即所谓暗蛋白质组，限制了对生物学功能与治疗潜力的认识。 文章梳理AI结构预测、冷冻电镜、功能基因组学与多组学等技术在探索暗蛋白质组方面的应用机会。
从头设计塑造半合成导电蛋白孔道
研究通过从头设计构建半合成导电蛋白孔道。 摘要缺失，无法获知具体设计策略与实验方法。
监督分子动力学模拟捕捉HuR结构域闭合过程
该研究用分子动力学模拟比较HuR的apo开放态与RNA结合闭合态，发现常规模拟无法捕捉开放到闭合的转变，遂将监督分子动力学（SuMD）拓展用于分子内结构域闭合，成功重现类实验RNA结合构象并提出可能的再闭合路径；结果提示该方法可扩展至分子内构象转变研究，属计算模拟层面的机制提示。
